اثرات بالقوه سامانه کشاورزی ارگانیک را می‌توان بر روی سلامت افراد جامعه، منابع طبیعی، دام، هوا و غنی سازی و حاصلخیزی خاک و غیره مشاهده نمود. تاثیرات فوق را به چهار گروه عمده اجتماعی، اقتصادی، کشاورزی و زیست محیطی تعبیر می‌کنند.

* تاثیرات اجتماعی:

• بهبود شرایط سلامت افراد
• ایجاد اشتغال و فرصتهای تحصیل و آموزش بهتر
• کاهش مهاجرت روستایی
• ذخیره سازی برای مدت طولانی‌تر

* تاثیرات اقتصادی:

• کاهش 40.6 درصدی هزینه‌ها
• حفظ و امنیت اقتصادی بیشتر درآمد روستایی و اقتصاد قوی‌تر روستایی
• کاهش سرمایه‌گذاری نقدی
• بازدهی بالا و خطرپذیری کمتر

* تاثیرات کشاورزی:

• حفظ و نگهداری بانک گونه‌های کشاورزی
• تعادل و یکنواختی در کیفیت محصولات غذایی
• حاصلخیزی و غنی‌تر کردن خاک در برابر فعالیت‌های میکروبی در خاک و در نهایت مقاومت بیشتر خاک در برابر آفات و بیماری‌ها
• ایجاد خود اتکایی در تولید محصولات کشاورزی

* تاثیرات زیست محیطی:

• کاهش آلودگی در خاک
• حفظ و نگهداری مواد مغذی در خاک و میکرو ارگانیسم‌های خاک
• کنترل بیشتر فساد و فرسودگی در خاک
• رسیدگی و بررسی آلودگی آب و هوا
•  دوام و ماندگاری بیشتر در محصولات کشاورزی